Le projet EduMed Observatory est suivi par un comité scientifique.
Ce dernier est composé de représentants de l'Education Nationale et de l'Enseignement Supérieur.Les travaux de ce comité consistent à suivre les opérations entreprises dans le cadre du projet, et d'en évaluer l'impact sur le segment bac-3/bac+3, conformément au cahier des charges de projet IDEX JEDI de Université Côte d'Azur.